El valor de la matrícula semestral para maestrías y especializaciones es de cinco salarios mínimos legales mensuales vigentes (5 SMLMV), que pueden pagarse utilizando una de las siguientes modalidades:

Apoyos e incentivos para el pago de matrícula en Posgrado 

• Descuento por pronto pago: se hará un descuento correspondiente al 10% del derecho de matrícula, siempre y cuando el valor sea cancelado dentro de los plazos previstos en el calendario académico aprobado por el Consejo Académico. Este no es acumulable con otras exenciones, con excepción del descuento electoral.
  
• Pago fraccionado: los derechos de matrícula podrán ser cancelados bajo la modalidad de fraccionamiento en tres cuotas, teniendo en cuenta el calendario operativo.
  
• Descuento de 2.5 SMMLV por semestre para estudiantes del Doctorado según el Acuerdo 11 del 2009, art. 3.
  
• Descuento del 90% en el valor de la matrícula para docentes de planta, funcionarios administrativos de planta y trabajadores oficiales de la Universidad, hasta por el número de periodos académicos establecidos para cada programa de posgrado.
  
• Descuento del 75% del valor de la matrícula para profesores ocasionales de la Universidad Pedagógica Nacional (Acuerdo 016 de 2005).
  
• Descuento del 50% para los profesores catedráticos de la Universidad Pedagógica Nacional (Requisitos Acuerdo 016 de 2005).
  
• La Universidad otorga hasta 2 becas anules del 100% del valor de la matrícula en los programas de posgrado para los egresados de pregrado que obtengan premios a nivel nacional o internacional por su desempeño como docentes o investigadores en los ámbitos educativo, pedagógico, científico, tecnológico, ambiental, deportivo, social, cultural o político (Acuerdo 010 del 1 de junio de 2016).
  
• Descuentos a egresados de pregrado por el 20% en el valor de la matrícula de los programas de posgrado (Acuerdo 016 del 5 de septiembre de 2019).
• Descuento del 10% por certificado electoral.
  
• Exención en el valor de la matrícula al candidato a Doctor(a) que cumpla las condiciones establecidas en el Acuerdo 012 del 1 de junio de 2011.
  
• Descuentos del 50% por representación en los cuerpos colegiados en el pago de derechos de matrícula en los programas curriculares de posgrado para dos (2) egresados al año, que en su calidad de estudiante de pregrado y/o posgrado hayan ejercido representación estudiantil en el Consejo Superior universitario y/o el Consejo Académico.

Nota:
El costo de la Maestría en Desarrollo Educativo y Social (en convenio con la Fundación Centro Internacional de Educación y Desarrollo Humano-CINDE), es de 6,5 SMLMV por semestre. Las modalidades de pago antes mencionadas no aplican para la Maestría en Desarrollo Educativo y Social (en convenio con la Fundación Centro Internacional de Educación y Desarrollo Humano-CINDE).